Modifikationsgegenstände, kurz "Mods", sind dazu gedacht, Waffen jeglicher Art zu verbessern, und mit speziellen Eigenschaften zu versehen. Manche Gegenstände, die von Handwerkern hergestellt werden, haben bereits Anschlüsse, Sockel oder Slots für verschiedenste Modifikationen. Einmal eingesetzt, übertragen die Mods dem Gegenstand ihre Stärke und Fähigkeiten. Je mächtiger die Mods sind, desto mehr Willenskraft wird für den Gegenstand, der diesen Mod enthält, benötigt.

Ihr könnt ganz einfach herausfinden, ob ein Objekt Modslots besitzt, indem Ihr den Mauszeiger über den Gegenstand platziert. Sollten entsprechende Slots vorhanden sein, so sind unter den Eigenschaften des Objektes Symbole abgebildet, wie z.B ein Zahnrad oder ein Pentagramm. Ihr könnt die Modslots anhand der Modifikationsverwaltung einsehen und dort auch neue Mods einsetzen. Um die Modifikationsverwaltung zu öffnen, müsst Ihr den gewünschten Gegenstand mit der rechten Maustaste anklicken und gedrückt halten. Im Aktionsmenü wählt ihr das Untersuchensymbol (Schraubenschlüssel) aus.
Die Anzahl von Modslots ist zufallsgeneriert und hängt auch von der Größe und Typ des Objektes ab. Wenn Ihr eine Waffe findet, wie im Bild oben zu sehen ist, dann hattet Ihr weniger Glück. Aber es werden Euch noch einige Waffen in die Hände fallen, die weit mehr als 6 Modslots besitzen.
Um einen Gegenstand mit Mods auszurüsten, müsst Ihr den Mod einfach über den gewünschten Gegenstand ziehen. Wenn Ihr in der Modifikationsverwaltung seid, werden passende Mods im Inventar grün umrandet sein, vorausgesetzt es sind noch Sockel frei.
Hinweis: Modifikationen können nur gegen Palladium wieder aus dem Gegenstand entfernt werden. Die entfernten Mods bleiben dabei aber erhalten und können wieder verwendet werden. Ein Gegenstand, der Mods beinhaltet, kann auch nicht demontiert werden.